精准基因组医学研究室
发布日期:2023-03-28          银河集团186net


一、团队简介

精准基因组医学(Genomic and Precision Medicine团队的研究方向是,以精准医学为导向利用基因组、转录组、表观组等多组学手段,结合高通量测序以及细胞和疾病动物模型,研究包括分子机制及诊断。主要包括两方面的研究:(1)神经系统疾病或肿瘤等疾病中的微生物-宿主互作及其表观调控;(2)遗传病的致病机制及其诊治。

实验室主页网址请见:https://www.x-mol.com/groups/chenlab

二、团队负责人简介

陈建欢,博士,银河集团186net教授,博士生导师,医学遗传学教研室主任,精准基因组医学实验室/银河集团186net-广东省科学院动物研究所“慢性病灵长类研究“联合实验室负责人,银河集团186net一流学科建设团队成员。中山大学生物技术/计算机科学与技术专业学士,香港科技大学生物化学(分子医学)博士,香港中文大学博士后。2012年起任汕头大学银河集团186net教授。2016年起任银河集团186net银河集团186net教授。主要从事研究微生物-宿主互作中的作用及表观调控机制等,研究成果在顶级学术期刊发表SCI论文40多篇,累计影响因子超过170。主持3项国家自然科学基金在内的国家级省级科研项目10项,与国内科研院所和企业合作完成科研服务项目6项,申请国家发明专利8项,已获授权1项。入选广东省特支计划百千万工程青年拔尖人才、扬帆计划培养高层次人才、江苏省高层次创新创业人才引进计划“双创博士”、江苏省“六大人才高峰”项目、无锡“太湖人才计划”创新领军人才。任Frontiers in Genetics副主编(影响因子4.6)、Frontiers in Psychiatry副主编(影响因子4.1)、Frontiers in Molecular Neuroscience客座编辑和30多个SCI期刊审稿人,江苏省免疫学会转化医学专业委员会委员,国家自然科学基金、教育部高校科学研究优秀成果奖、广东省杰出青年基金和浙江省杰出青年基金等多个国家级、省级项目和科技奖评审专家,广东省高层次人才评审专家库成员。

研究方向

1.微生物-宿主互作及其表观调控。

2.遗传病的分子机制、诊断和基因治疗。

主持的主要科研项目

1.国家自然科学基金面上项目(2项)

2.国家自然科学基金青年项目

3.广东省科技计划社会发展类项目

4.广东省自然科学基金面上项目(2项)

5.中央高校基本科研重点项目(共同主持)

6.中央高校基本科研业务费专项资金

7.无锡卫生健康委员会转化医学项目

入选人才项目

1.广东省特支计划百千万工程青年拔尖人才

2.广东省扬帆计划培养高层次人才

3.江苏省高层次创新创业人才引进计划“双创博士”

4.江苏省“六大人才高峰”项目(罕见病的精准医学及靶向治疗研究平台)

5.无锡“太湖人才计划”创新领军人才

近5年发表的第一或通讯作者论文:

1.Zhi-Yuan Wei#, Zhi-Xin Wang#, Jia-Huan Li, Yan-Shuo Wen, Di Gao, Shou-Yue Xia, Yu-Ning Li, Xu-Bing Pan, Yan-Shan Liu, Yun-Yun Jin*,Jian-Huan Chen*. Host A-to-I RNA editing signatures in intracellular bacterial and single-strand RNA viral infections.Frontiers in Immunology.In press.

2.Kong F, Ren C, Jia R, Zhou Y,Chen J*, Ma Y*. Systematic Pan-Cancer Analysis Identifies SLC31A1 as a Biomarker in Multiple Tumor Types.BMC Medical Genomics.2023 accepted.

3.Ying Chen, Fu-Xia Ru, Jun-Jie Feng, JJi Tao, Zhi-Yuan Wei, Chengjia Qian, Qiong Lin*,Jian-Huan Chen*. Gastric juice microbiota in pediatric chronic gastritis clinically tested positive and negative for Helicobacter pylori.Frontiers in Microbiology. 2023 accepted.

4.He A, Wang P, Zhu A, Liu Y,Chen J*, Liu L*. Predicting IDH Mutation Status in Low-Grade Gliomas Based on Optimal Radiomic Features Combined with Multi-Sequence Magnetic Resonance Imaging. Diagnostics.Diagnostics; 2022;12(12):2995.

5.Wei ZY#, Rao JH#, Tang MT, Zhao GA, Li QC, Wu LM, Liu SQ, Li BH, Xiao BQ, Liu XY,Chen JH*.Characterization of changes and driver microbes in gut microbiota during healthy aging using a captive monkey model.Genomics Proteomics and Bioinformatics,2022.

6.Zhang X, Li M, Li B, Liao N, Wei Z, Gao J, Sun Y,Chen J*, Rao J*, Wen F*. Ageing fundus degenerations of Macaca fascicularis on multi-modal imaging and histopathology: Similarities and differences compared to human.Experimental Eye Research.2022;220:109126.

7.Zhang JQ#, Pan JQ#, Wei ZY, Ren CY, Ru FX, Xia SY, He YS,Lin K*, Chen JH*. Brain Epitranscriptomic Analysis Revealed Altered A-to-I RNA Editing in Septic Patients.Frontiers in Genetics.2022;13.

8.Ru FX#, Kong F#, Ren CY, He YS, Xia SY, Li YN, Liang YP, Feng JJ, Wei ZY,Chen JH*. Repeated Winning and Losing Experiences in Chronic Social Conflicts Are Linked to RNA Editing Pattern Difference.Frontiers in Psychiatry. 2022;13.

9.Gao JM#, Rao JH#*, Wei ZY#, Xia SY, Huang L, Tang MT, Hide G, Zheng TT, Li JH, Zhao GA, Sun YX,Chen JH*. Transplantation of Gut Microbiota from High-Fat-Diet-Tolerant Cynomolgus Monkeys Alleviates Hyperlipidemia and Hepatic Steatosis in Rats.Frontiers in Microbiology. 2022;13.

10.Zhang J, Tao J, Gao RN, Wei ZY, He YS, Ren CY, Li QC, Liu YS, Wang KW, Yang G, Qian C*,Chen JH*. Cytotoxic T-Cell Trafficking Chemokine Profiles Correlate With Defined Mucosal Microbial Communities in Colorectal Cancer.Frontiers in Immunology. 2021;12:3274.

11.Xia Y#*, Wei ZY#, He R, Li JH, Wang ZX, Huo JD,Chen JH*. Hybrid de novo Genome Assembly of Erwinia sp. E602 and Bioinformatic Analysis Characterized a New Plasmid-Borne lac Operon Under Positive Selection.Frontiers in Microbiology.2021;12:3471.

12.Liu YS, Pan JQ, Wan JF, Ren CY, Xu ZH, Pan XB, Gao RN, Liu SQ, Zhang JL, Yao QH, Wang JH, Li EM, Rao JH, Hou P*,Chen JH*. A novel missense mutation of RPGR identified from retinitis pigmentosa affects splicing of the ORF15 region and causes loss of transcript heterogeneity.Biochemical and Biophysical Research Communications. 2020;531(2):172–9.

13.Tao J, Ren CY, Wei ZY, Zhang F, Xu J*,Chen JH*. Transcriptome-Wide Identification of G-to-A RNA Editing in Chronic Social Defeat Stress Mouse Models.Frontiers in Genetics. 2021;12:701.

14.Liu Z, Wei Z-Y, Chen J, Chen K, Mao X, Liu Q, Sun Y, Zhang Z, Zhang Y, Dan Z, Tang J, Qin L,Chen JH*, Liu X*. Acute Sleep-Wake Cycle Shift Results in Community Alteration of Human Gut Microbiome.mSphere. 2020.5(1).

15.Xue CB#, Xu ZH#, Zhu J, Wu Y, Zhuang XH, Chen QL, Wu CR, Hu JT, Zhou HS, Xie WH, Yi X, Yu SS, Peng ZY, Yang HM, Hong XH*,Chen JH*.Exome Sequencing Identifies TENM4 as a Novel Candidate Gene for Schizophrenia in the SCZD2 Locus at 11q14-21.Frontiers in Genetics.2018;9.

16.Luo X#, Chen S#, Xue L,Chen JH*,Shi YW*, Zhao H*. SNP Variation of RELN Gene and Schizophrenia in a Chinese Population: A Hospital-Based Case–Control Study.Front. Genet.2019;10.

17.Wang KW#, Xiao BQ#, Li BH, Liu YY, Wei ZY, Rao JH*,Chen JH*. Effects of fat-to-sugar ratio in excess dietary energy on lipid abnormalities: a 7-month prospective feeding study in adult cynomolgus monkeys.Lipids Health Dis.2019;18(1):1.

18.Yu M, Wei ZY, Xu ZH, Pan JQ,Chen JH#. Oxidative Damage and Nrf2 Translocation Induced by Toxicities of Deoxynivalenol on the Placental and Embryo on Gestation Day 12.5 d and 18.5 d.Toxins.2018; 10(9):370.

19.Wu HK#,Chen JH#, Yang L, Li AR, Su D-H, Lin YP, Chen DQ. Emergence and genomic analysis of MDR Laribacter hongkongensis strain HLGZ1 from Guangzhou, China.J Antimicrob Chemother.2018;73(3):643–7.

三、团队成员简介


马亚萍,儿科学博士,副主医师,硕士研究生导师,银河集团186net附属医院儿内科副主任。现任江苏省医学会儿科分会小儿内分泌学组委员,江苏省妇幼健康研究会第一届儿童生长发育促进专业委员会委员,为无锡市“双百”中青年医疗卫生后备拔尖人才、无锡市医学重点人才培育对象。在小儿内分泌领域的临床和研究已有17余年,曾在美国霍普金斯银河集团186net和儿童医院进修小儿内分泌临床和研究一年。近年来先后获得省级新技术新项目引进奖和市科技进步奖等,在《Frontiers in Physiology》、《Endocrinology》、《BMC Pediatr》、《BMC Medical Genomics》等权威性学术期刊上发表学术论文30余篇,其论文参加过国际(亚洲儿科大会和亚太儿科大会壁报交流)及全国、江苏省儿科内分泌年会(大会发言)交流。擅长小儿常见内分泌疾病如性早熟、特发性矮小等的诊断和治疗。

主要从事儿童下丘脑-垂体-性腺轴等相关的儿童内分泌、遗传代谢性疾病的研究。


刘彦山,博士,副研究员。近五年获得包括国家自然科学基金面上基金在内的4项省级以上课题资助。发表SCI论文15篇,其中以第一作者或通讯作者发表4篇,共同作者1篇。研究发现为单基因遗传病致病机制及基因治疗。

担任SCI期刊Frontiers in genetics、Frontiers in Psychiatry审稿编辑,Clinical Oral Investigations,BMC Medical Genomic等杂志审稿人。


金云云,博士,讲师。在Front Microbiol、Virol Sin、J Cell Physiology以及Cell Biosci等国际期刊上发表SCI论文共13篇,累计影响因子为94,其中以第一作者和通讯作者身份发表SCI论文7篇,中科院2区的共4篇。申请并获批国家发明专利2项。参与国家自然科学基金面上项目以及省级项目共6项。

主要研究方向:病毒自身复制与转录机制;病毒对宿主RNA编辑影响及作用机制。


潘旭斌,博士,副主任医师,硕士研究生导师,江苏省医师协会青光眼与防盲学组委员。擅长:儿童及青少年近视防控、视网膜疾病以及遗传性眼病的诊断与治疗。

研究方向主要为近视防控与视网膜疾病方向。主要研究兴趣是视网膜遗传病的致病机制及其诊治,儿童及青少年近视发病机制。

上一条:乳腺癌精准与转化医学研究室

下一条:肿瘤代谢研究室

关闭

技术支持:信息化建设管理处

地址:江苏省无锡市蠡湖大道1800号

邮编:214122

联系电话:0510-85328363